Gene Information
Gene NameKDM4D
OrganismHomo sapiens (Human)
Gene Length523
Protein NamesLysine-specific demethylase 4D (EC 1.14.11.66) (JmjC domain-containing histone demethylation protein 3D) (Jumonji domain-containing protein 2D) ([histone H3]-trimethyl-L-lysine(9) demethylase 4D)
Target NameNA
Target TypeNA
Gene Age101 ( ENSG00000186280 )
Evolutionary StageEukaryota
AlphaFoldDBQ6B0I6
Gene CardKDM4D
Uniprot IDQ6B0I6
PfamPF02373; PF02375
In ASDno
Allosteric Predictionno (-0.434013647)
Ortholog in AnimalsAlpaca_ KDM4D ( ortholog_one2one )
GuineaPig_ KDM4D ( ortholog_one2one )
Macaque_ KDM4D ( ortholog_one2one )
Mouse_ Kdm4d ( ortholog_one2one )
Rat_ Kdm4d ( ortholog_one2one )
OhnologsKDM4B, KDM4A
ParalogsJARID2, KDM4C, KDM4F, KDM4E, KDM4B, KDM5B, KDM5C, KDM5D, KDM4A, KDM5A
Tissuetestis
Tissue SpecificityNA
Pharmacological Animal ModelsNA
Gene Ontology
(biological process)
Gene Ontology
(cellular component)
Gene Ontology
(molecular function)
PDB 3DXT  (X-ray  1.80A  3DXU  (X-ray  2.20A  4D6Q  (X-ray  1.29A  4D6R  (X-ray  1.40A  4D6S  (X-ray  1.40A  4HON  (X-ray  1.80A  4HOO  (X-ray  2.50A  5F5A  (X-ray  1.41A  5F5C  (X-ray  1.88A  5FP4  (X-ray  2.00A  5FP7  (X-ray  2.00A  5FP8  (X-ray  1.98A  5FP9  (X-ray  2.00A  5FPA  (X-ray  1.96A  5FPB  (X-ray  1.91A  5PH0  (X-ray  1.34A  5PH1  (X-ray  1.25A  5PH2  (X-ray  1.45A  5PH3  (X-ray  1.24A  5PH4  (X-ray  1.27A  5PH5  (X-ray  1.35A  5PH6  (X-ray  1.74A  5PH7  (X-ray  1.43A  5PH8  (X-ray  1.40A  5PH9  (X-ray  1.48A  5PHA  (X-ray  1.45A  5PHB  (X-ray  1.34A  5PHC  (X-ray  1.29A  5PHD  (X-ray  1.36A  5PHE  (X-ray  1.35A  5PHF  (X-ray  1.39A  5PHG  (X-ray  1.40A  5PHH  (X-ray  1.60A  5PHI  (X-ray  1.97A  5PHJ  (X-ray  1.15A  5PHK  (X-ray  1.25A  5PHL  (X-ray  1.14A  5PHM  (X-ray  1.40A  5PHN  (X-ray  1.29A  5PHO  (X-ray  1.40A  5PHP  (X-ray  1.72A  5PHQ  (X-ray  2.23A  5PHR  (X-ray  1.66A  5PHS  (X-ray  2.54A  5PHT  (X-ray  1.83A  5PHU  (X-ray  1.79A  5PHV  (X-ray  1.83A  5PHW  (X-ray  1.31A  5PHX  (X-ray  1.27A  5PHY  (X-ray  1.34A  5PHZ  (X-ray  1.47A  5PI0  (X-ray  1.50A  5PI1  (X-ray  1.34A  5PI2  (X-ray  1.52A  5PI3  (X-ray  1.29A  5PI4  (X-ray  1.35A  5PI5  (X-ray  1.42A  5PI6  (X-ray  1.29A  5PI7  (X-ray  1.61A  5PI8  (X-ray  1.27A  5PI9  (X-ray  1.45A  5PIA  (X-ray  1.18A  5PIB  (X-ray  1.64A  5PIC  (X-ray  1.29A  5PID  (X-ray  1.50A  5PIE  (X-ray  1.42A  5PIF  (X-ray  1.37A  5PIG  (X-ray  1.44A  5PIH  (X-ray  1.79A  5PII  (X-ray  1.45A  5PIJ  (X-ray  1.45A  5PIK  (X-ray  1.80A  5PIL  (X-ray  1.65A  5PIM  (X-ray  1.25A  5PIN  (X-ray  1.50A  5PIO  (X-ray  1.72A  5PIP  (X-ray  1.42A  5PIQ  (X-ray  1.50A  5PIR  (X-ray  1.45A  5PIS  (X-ray  1.30A  5PIT  (X-ray  1.79A  5PIU  (X-ray  1.48A  5PIV  (X-ray  1.43A  5PIW  (X-ray  1.23A  5PIX  (X-ray  1.35A  5PIY  (X-ray  1.31A  5PIZ  (X-ray  1.38A  5PJ0  (X-ray  1.31A  5PJ1  (X-ray  1.35A  5PJ2  (X-ray  1.44A  5PJ3  (X-ray  1.30A  5PJ4  (X-ray  1.52A  5PJ5  (X-ray  1.24A  5PJ6  (X-ray  1.35A  5PJ7  (X-ray  1.39A  5PJ8  (X-ray  1.40A  5PJ9  (X-ray  1.50A  5PJA  (X-ray  1.89A  5PJB  (X-ray  1.58A  5PJC  (X-ray  1.40A  5PJD  (X-ray  1.43A  5PJE  (X-ray  1.37A  5PJF  (X-ray  1.47A  5PJG  (X-ray  1.40A  5PJH  (X-ray  1.18A  5PJI  (X-ray  1.34A  5PJJ  (X-ray  1.67A  5PJK  (X-ray  1.69A  5PJL  (X-ray  1.52A  5PJM  (X-ray  1.43A  5PJN  (X-ray  1.48A  5PJO  (X-ray  1.35A  5PJP  (X-ray  1.39A  5PJQ  (X-ray  1.38A  5PJR  (X-ray  1.29A  5PJS  (X-ray  1.64A  5PJT  (X-ray  1.54A  5PJU  (X-ray  1.27A  5PJV  (X-ray  1.34A  5PJW  (X-ray  1.56A  5PJX  (X-ray  1.35A  5PJY  (X-ray  1.34A  5PJZ  (X-ray  1.29A  5PK0  (X-ray  1.28A  5PK1  (X-ray  1.35A  5PK2  (X-ray  1.42A  5PK3  (X-ray  1.42A  5PK4  (X-ray  1.72A  5PK5  (X-ray  1.39A  5PK6  (X-ray  2.38A  5PK7  (X-ray  1.29A  5PK8  (X-ray  1.44A  5PK9  (X-ray  1.34A  5PKA  (X-ray  1.71A  5PKB  (X-ray  1.40A  5PKC  (X-ray  1.29A  5PKD  (X-ray  1.55A  5PKE  (X-ray  1.44A  5PKF  (X-ray  1.34A  5PKG  (X-ray  1.54A  5PKH  (X-ray  1.19A  5PKI  (X-ray  1.19A  5PKJ  (X-ray  1.22A  5PKK  (X-ray  1.50A  5PKL  (X-ray  1.35A  5PKM  (X-ray  1.37A  5PKN  (X-ray  1.30A  5PKO  (X-ray  2.38A  5PKP  (X-ray  1.30A  5PKQ  (X-ray  1.28A  5PKR  (X-ray  1.31A  5PKS  (X-ray  1.50A  5PKT  (X-ray  1.50A  5PKU  (X-ray  1.47A  5PKV  (X-ray  1.35A  5PKW  (X-ray  1.35A  5PKX  (X-ray  1.45A  5PKY  (X-ray  1.25A  5PKZ  (X-ray  1.50A  5PL0  (X-ray  1.27A  5PL1  (X-ray  1.42A  5PL2  (X-ray  1.34A  5PL3  (X-ray  1.27A  5PL4  (X-ray  1.21A  5PL5  (X-ray  1.57A  5PL6  (X-ray  1.29A  5PL7  (X-ray  1.30A  5PL8  (X-ray  1.54A  5PL9  (X-ray  1.65A  5PLA  (X-ray  1.37A  5PLB  (X-ray  1.49A  5PLC  (X-ray  1.49A  5PLD  (X-ray  1.46A  5PLE  (X-ray  1.45A  5PLF  (X-ray  1.33A  5PLG  (X-ray  1.31A  5PLH  (X-ray  1.46A  5PLI  (X-ray  1.39A  5PLJ  (X-ray  1.49A  5PLK  (X-ray  1.14A  5PLL  (X-ray  1.28A  5PLM  (X-ray  1.14A  5PLN  (X-ray  1.14A  5PLO  (X-ray  1.14A  5PLP  (X-ray  1.46A  5PLQ  (X-ray  1.36A  5PLR  (X-ray  1.53A  5PLS  (X-ray  1.70A  5PLT  (X-ray  1.53A  5PLU  (X-ray  1.47A  5PLV  (X-ray  1.14A  5PLW  (X-ray  1.31A  5PLX  (X-ray  1.29A  5PLY  (X-ray  1.38A  5PLZ  (X-ray  1.71A  5PM0  (X-ray  2.14A  5PM1  (X-ray  1.54A  5PM2  (X-ray  1.52A  5PM3  (X-ray  1.46A  5PM4  (X-ray  1.44A  5PM5  (X-ray  1.76A  5PM6  (X-ray  1.78A  5PM7  (X-ray  1.43A  5PM8  (X-ray  1.54A  5PM9  (X-ray  1.50A  5PMA  (X-ray  1.29A  5PMB  (X-ray  1.63A  5PMC  (X-ray  1.58A  5PMD  (X-ray  1.63A  5PME  (X-ray  1.39A  5PMF  (X-ray  1.36A  5PMG  (X-ray  1.51A  5PMH  (X-ray  1.52A  5PMI  (X-ray  1.71A  5PMJ  (X-ray  1.37A  5PMK  (X-ray  1.44A  5PML  (X-ray  1.58A  5PMM  (X-ray  1.39A  5PMN  (X-ray  1.72A  5PMO  (X-ray  1.53A  5PMP  (X-ray  1.55A  5PMQ  (X-ray  1.46A  5PMR  (X-ray  1.51A  5PMS  (X-ray  1.24A  5PMT  (X-ray  1.22A  5PMU  (X-ray  1.48A  5PMV  (X-ray  1.34A  5PMW  (X-ray  1.19A  5PMX  (X-ray  1.14A  5PMY  (X-ray  1.29A  5PMZ  (X-ray  1.15A  5PN0  (X-ray  1.14A  5PN1  (X-ray  1.41A  5PN2  (X-ray  1.41A  5PN3  (X-ray  1.60A  5PN4  (X-ray  1.37A  5PN5  (X-ray  1.30A  5PN6  (X-ray  1.42A  5PN7  (X-ray  1.25A  5PN8  (X-ray  1.34A  5PN9  (X-ray  1.48A  5PNA  (X-ray  1.78A  5PNB  (X-ray  1.23A  5PNC  (X-ray  1.35A  5PND  (X-ray  1.49A  5PNE  (X-ray  1.29A  5PNF  (X-ray  1.24A  5PNG  (X-ray  1.38A  5PNH  (X-ray  1.14A  5PNI  (X-ray  1.45A  5PNJ  (X-ray  1.40A  5PNK  (X-ray  1.27A  5PNL  (X-ray  1.44A  5PNM  (X-ray  1.25A  5PNN  (X-ray  1.21A  5PNO  (X-ray  1.55A  5PNP  (X-ray  1.47A  5PNQ  (X-ray  1.47A  5PNR  (X-ray  1.14A  5PNS  (X-ray  1.36A  5PNU  (X-ray  1.14A  5PNV  (X-ray  1.60A  5PNW  (X-ray  1.40A  6ETE  (X-ray  1.47A  6ETG  (X-ray  1.28A  6ETS  (X-ray  1.33A  6ETT  (X-ray  1.26A  6ETU  (X-ray  1.33A  6ETV  (X-ray  1.18A  6ETW  (X-ray  1.35A  6F5Q  (X-ray  1.43A  6F5R  (X-ray  1.61A  6F5S  (X-ray  1.48A  6F5T  (X-ray  1.58A  6H0W  (X-ray  1.23A  6H0X  (X-ray  1.64A  6H0Y  (X-ray  1.21A  6H0Z  (X-ray  1.34A  6H10  (X-ray  1.10A  6H11  (X-ray  1.52A  7DYG  (X-ray  2.00A  7DYQ  (X-ray  2.00A 
DBSNP rs35631512  rs3740853  rs34366036 
Subcellular location [CC]Nucleus {ECO:0000255|PROSITE-ProRule:PRU00537}.
Mouse PG classificationNA
click here to return to the previous page