Gene Information
Gene NamePDE4D
OrganismHomo sapiens (Human)
Gene Length809
Protein NamescAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D (EC 3.1.4.53) (DPDE3) (PDE43)
Target Namephosphodiesterase enzymes
Target TypeNA
Gene Age950 ( ENSG00000113448 )
Evolutionary StageEukaryota
AlphaFoldDBQ08499
Gene CardPDE4D
Uniprot IDQ08499
PfamPF18100; PF00233
In ASDyes
Allosteric Predictionyes (1.461332349)
Ortholog in AnimalsAlpaca_ PDE4D ( ortholog_one2one )
Dog_ PDE4D ( ortholog_one2one )
GuineaPig_ PDE4D ( ortholog_one2one )
Macaque_ PDE4D ( ortholog_one2one )
Mouse_ Pde4d ( ortholog_one2one )
Pig_ PDE4D ( ortholog_one2one )
Rat_ Pde4d ( ortholog_one2one )
Rabbit_ PDE4D ( ortholog_one2one )
OhnologsPDE4A, PDE4C, PDE4B
ParalogsPDE8A, PDE4A, PDE4B, PDE6A, PDE2A, PDE6C, PDE8B, PDE1B, PDE9A, PDE10A, PDE1A, PDE7A, PDE3B, PDE1C, PDE11A, PDE5A, PDE3A, PDE7B, PDE6B, PDE4C
TissueNA
Tissue SpecificityExpressed in colonic epithelial cells (at protein level). Widespread;
most abundant in skeletal muscle. {ECO:0000269|PubMed:12834813, ECO:0000269|PubMed:17244609}.;
[Isoform 6]: Detected in brain. {ECO:0000269|PubMed:12834813, ECO:0000269|PubMed:17519386}.;
[Isoform 8]: Detected in brain, placenta, lung and kidney. {ECO:0000269|PubMed:12834813}.;
[Isoform 7]: Detected in heart and skeletal muscle. {ECO:0000269|PubMed:12834813}.
Pharmacological Animal ModelsNA
Gene Ontology
(biological process)
Gene Ontology
(cellular component)
Gene Ontology
(molecular function)
PDB 1E9K  (NMR  -  )  1MKD  (X-ray  2.90A  )  1OYN  (X-ray  2.00A  )  1PTW  (X-ray  2.30A  )  1Q9M  (X-ray  2.30A  )  1TB7  (X-ray  1.63A  )  1TBB  (X-ray  1.60A  )  1XOM  (X-ray  1.55A  )  1XON  (X-ray  1.72A  )  1XOQ  (X-ray  1.83A  )  1XOR  (X-ray  1.54A  )  1Y2B  (X-ray  1.40A  )  1Y2C  (X-ray  1.67A  )  1Y2D  (X-ray  1.70A  )  1Y2E  (X-ray  2.10A  )  1Y2K  (X-ray  1.36A  )  1ZKN  (X-ray  2.10A  )  2FM0  (X-ray  2.00A  )  2FM5  (X-ray  2.03A  )  2PW3  (X-ray  1.56A  )  2QYN  (X-ray  1.57A  )  3G4G  (X-ray  2.30A  )  3G4I  (X-ray  1.90A  )  3G4K  (X-ray  1.95A  )  3G4L  (X-ray  2.50A  )  3G58  (X-ray  2.05A  )  3IAD  (X-ray  2.65A  )  3IAK  (X-ray  2.80A  )  3K4S  (X-ray  2.05A  )  3SL3  (X-ray  2.10A  )  3SL4  (X-ray  1.90A  )  3SL5  (X-ray  2.65A  )  3SL6  (X-ray  2.44A  )  3SL8  (X-ray  2.60A  )  3V9B  (X-ray  2.10A  )  4OGB  (X-ray  2.03A  )  4W1O  (X-ray  2.20A  )  4WCU  (X-ray  2.35A  )  5K1I  (X-ray  2.61A  )  5K32  (X-ray  1.99A  )  5LBO  (X-ray  2.25A  )  5TKB  (X-ray  2.16A  )  5WH5  (X-ray  1.80A  )  5WH6  (X-ray  1.60A  )  5WQA  (X-ray  2.30A  )  6AKR  (X-ray  2.33A  )  6BOJ  (X-ray  1.70A  )  6F6U  (X-ray  1.83A  )  6F8R  (X-ray  1.83A  )  6F8T  (X-ray  1.80A  )  6F8U  (X-ray  2.10A  )  6F8V  (X-ray  1.85A  )  6F8W  (X-ray  1.60A  )  6F8X  (X-ray  1.95A  )  6FDC  (X-ray  1.45A  )  6FDI  (X-ray  1.90A  )  6FE7  (X-ray  2.00A  )  6FEB  (X-ray  1.93A  )  6FET  (X-ray  1.88A  )  6FT0  (X-ray  2.10A  )  6FTA  (X-ray  2.34A  )  6FTW  (X-ray  2.16A  )  6FW3  (X-ray  1.78A  )  6HWO  (X-ray  1.99A  )  6IAG  (X-ray  2.00A  )  6IBF  (X-ray  2.31A  )  6IM6  (X-ray  1.70A  )  6IMB  (X-ray  1.55A  )  6IMD  (X-ray  1.50A  )  6IMI  (X-ray  1.46A  )  6IMO  (X-ray  1.55A  )  6IMR  (X-ray  1.50A  )  6IMT  (X-ray  1.48A  )  6IND  (X-ray  1.87A  )  6INK  (X-ray  1.70A  )  6INM  (X-ray  2.00A  )  6KJZ  (X-ray  2.20A  )  6KK0  (X-ray  2.20A  )  6LRM  (X-ray  1.45A  )  6NJH  (X-ray  2.15A  )  6NJI  (X-ray  2.45A  )  6NJJ  (X-ray  2.30A  )  6RCW  (X-ray  2.08A  )  6ZBA  (X-ray  1.60A  )  7A8Q  (X-ray  2.24A  )  7A9V  (X-ray  2.17A  )  7AAG  (X-ray  1.79A  )  7AB9  (X-ray  2.19A  )  7ABD  (X-ray  2.41A  )  7ABE  (X-ray  1.83A  )  7ABJ  (X-ray  2.11A  )  7AY6  (X-ray  1.66A  )  7B9H  (X-ray  1.50A  )  7CBJ  (X-ray  1.50A  )  7CBQ  (X-ray  1.59A  )  7F2K  (X-ray  2.10A  )  7F2L  (X-ray  2.10A  )  7F2M  (X-ray  2.20A  )  7W4X  (X-ray  2.20A  )  7W4Y  (X-ray  2.10A  )  7XBB  (X-ray  2.10A  ) 
DBSNP rs397514466  rs397514464  rs397514465  rs397514468  rs397515433  rs397514467  rs397514469  rs587777188 
Subcellular location [CC]Apical cell membrane {ECO:0000269|PubMed:14500724}. Cytoplasm {ECO:0000250}. Membrane {ECO:0000250}. Cytoplasm, cytoskeleton {ECO:0000250}. Cytoplasm, cytoskeleton, microtubule organizing center, centrosome {ECO:0000250}. Note=Found in the soluble fraction, associated with membranes, and associated with the cytoskeleton and the centrosome (By similarity). Colocalized with SHANK2 to the apical membrane of colonic crypt cells. {ECO:0000250}.
Mouse PG classificationLPG
click here to return to the previous page